エディタの秀丸を常駐モードにしてトレイに入れておきます。トレイ中の秀丸をダブルクリックすると、新規作成の新しいウィンドウが開きますが、このとき秀丸がもうひとつトレイに逮捕されるような状態になります。

常駐秀丸がトレイから新規作成するときに、隠しのアイコン表示のウィンドウを作るのですが、これを逮捕してしまうようです。現在対策を検討中です。